Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPB41L4AQ9HCS5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L4AQ9HCS5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms