Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00574Q9H8X3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms