Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRDE2Q9H7Z3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms