Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms