Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP44Q9C0F1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP44Q9C0F1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms