Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms