Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms