Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms