Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
SCAPERQ9BY12 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCAPERQ9BY12 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms