Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms