Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms