Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms