Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL3Q9BXA9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms