Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms