Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms