Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms