Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT17Q9BSW7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms