Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms