Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms