Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms