Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC5LQ99459 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms