Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCLRE1CQ96SD1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms