Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIGSQ96S52 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms