Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3Q96PU9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ODF3Q96PU9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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