Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf72Q96LT7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms