Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms