Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SENP8Q96LD8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SENP8Q96LD8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SENP8Q96LD8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SENP8Q96LD8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms