Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD4Q96KN9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms