Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DCHS1Q96JQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms