Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms