Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM17Q96I25 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms