Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms