Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms