Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAF2Q96CS3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms