Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NXNL1Q96CM4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms