Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC1Q96C34 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms