Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF428Q96B54 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms