Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC8Q96B26 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC8Q96B26 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms