Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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GTF3C6Q969F1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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