Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HGDQ93099 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HGDQ93099 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HGDQ93099 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HGDQ93099 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HGDQ93099 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HGDQ93099 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HGDQ93099 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms