Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113Q902F9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms