Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ACER1Q8TDN7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACER1Q8TDN7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms