Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSNK2A3Q8NEV1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms