Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC191Q8NCU4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms