Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC63Q8NA47 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms