Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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CSGALNACT2Q8N6G5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSGALNACT2Q8N6G5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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