Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP4Q8N2S1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP4Q8N2S1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms