Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms