Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV8

UBR2, E3 ubiquitin-protein ligase UBR2, humanhuman

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR2Q8IWV8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR2Q8IWV8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms