Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms